summaryrefslogtreecommitdiffstats
path: root/biology/p5-Bio-Phylo/pkg-plist
blob: c353f68e831c51aa0836b628fbe3f4bc59f35070 (plain)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
%%SITE_PERL%%/%%PERL_ARCH%%/auto/Bio/Phylo/.packlist
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/EvolutionaryModels.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Factory.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/DrawNode.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/DrawTree.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/Node.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/NodeRole.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/Tree.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Forest/TreeRole.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Generator.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/IO.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Identifiable.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Listable.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/ListableRole.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Manual.pod
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Character.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Characters.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Continuous.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Custom.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Dna.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Illumina.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Mixed.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Protein.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Restriction.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Rna.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Sanger.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Solexa.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datatype/Standard.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Datum.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/DatumRole.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/Matrix.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/MatrixRole.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Matrices/TypeSafeData.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Mediators/TaxaMediator.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/F81.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/GTR.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/HKY85.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/JC69.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Models/Substitution/Dna/K80.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Document.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Document/Libxml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Document/Twig.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Element.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Element/Libxml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/DOM/Element/Twig.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/Entities.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/Meta.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/Meta/XMLLiteral.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/NeXML/Writable.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Abstract.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Adjacency.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Fasta.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Fastq.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Figtree.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Json.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Newick.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Nexml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Nexus.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Phylip.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Phyloxml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Table.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Taxlist.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Tnrs.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Tolweb.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Ubiocbmeta.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Ubiometa.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Parsers/Ubiosearch.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Client.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Resource.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Resource/Description.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Service.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Service/Timetree.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Service/Tolweb.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Service/UbioClassificationBank.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/PhyloWS/Service/UbioNameBank.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Project.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Set.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Taxa.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Taxa/TaxaLinker.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Taxa/Taxon.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Taxa/TaxonLinker.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Abstract.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Canvas.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Gif.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Jpeg.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Pdf.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Png.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Processing.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Svg.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Treedrawer/Swf.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Abstract.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Adjacency.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Cdao.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Fasta.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Hennig86.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Html.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Json.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Mrp.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Newick.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Nexml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Nexus.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Pagel.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Phylip.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Phyloxml.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Rss1.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Unparsers/Taxlist.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/CONSTANT.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/CONSTANT/Int.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/Dependency.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/Exceptions.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/IDPool.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/Logger.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/MOP.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/OptionalInterface.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/Phylo/Util/StackTrace.pm
%%SITE_PERL%%/Bio/PhyloRole.pm
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Factory.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::Node.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::NodeRole.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::Tree.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Forest::TreeRole.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Generator.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::IO.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Identifiable.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Listable.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::ListableRole.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Manual.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Character.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Characters.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Illumina.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Sanger.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Solexa.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Datum.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::DatumRole.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::MatrixRole.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::Entities.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::Meta.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::NeXML::Writable.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Abstract.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Adjacency.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Fasta.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Fastq.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Figtree.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Json.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Newick.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Phylip.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Phyloxml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Table.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Tnrs.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Ubiocbmeta.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Ubiometa.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Parsers::Ubiosearch.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Client.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Resource.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Resource::Description.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Service.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Timetree.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Service::Tolweb.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Service::UbioClassificationBank.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::PhyloWS::Service::UbioNameBank.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Project.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Set.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Taxa.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Jpeg.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Pdf.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Processing.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Treedrawer::Swf.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Abstract.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Adjacency.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Cdao.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Fasta.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Hennig86.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Html.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Json.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Phylip.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Phyloxml.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Rss1.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Unparsers::Taxlist.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::CONSTANT::Int.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::Dependency.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::Exceptions.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::IDPool.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::Logger.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::MOP.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::OptionalInterface.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::Phylo::Util::StackTrace.3.gz
%%PERL5_MAN3%%/Bio::PhyloRole.3.gz
OpenPOWER on IntegriCloud